Skip to main content

Отображение сетевого контента Отображение сетевого контента

Cryo-EM

Отображение сетевого контента Отображение сетевого контента

Отображение сетевого контента Отображение сетевого контента

Отображение сетевого контента Отображение сетевого контента

Kriomikroskopia SOLARIS

Kriomikroskopia SOLARIS jest specjalistyczną pracownią, która dysponuje dwoma najwyższej klasy mikroskopami transmisyjnymi przeznaczonymi do analiz strukturalnych z wykorzystaniem technik: analizy pojedynczych cząstek (ang. single particle analysis, SPA), kriotomografii elektronowej (ang. cryo-electron tomography, cET) oraz dyfrakcji elektronowej na mikrokryształach (ang. microcrystal electron diffraction, MicroED).

Opis metody badawczej

Transmisyjna kriomikroskopia elektronowa (Krio-TEM) jest metodą obrazowania opartą na elastycznym rozpraszaniu wiązki elektronów przechodzących przez badany preparat. Elektrony rozproszone podczas transmisji tworzą na detektorze dwuwymiarową, powiększoną projekcję obserwowanych obiektów, np. molekuł zawieszonych w szklistej warstwie lodu. Dzięki krótkiej fali elektronów (rzędu pikometrów) możliwe jest uzyskanie niemal atomowej rozdzielczości pomiaru.
Dla obserwacji Krio-TEM kluczowe jest odpowiednie przygotowanie preparatu. Najczęściej próbkę (molekuły w roztworze buforu) zamraża się poprzez bardzo szybkie zanurzenie siatki mikroskopowej z naniesioną próbką w ciekłym etanie. Zapobiega to krystalizacji cząsteczek wody, a utworzony lód amorficzny unieruchamia cząsteczki i umożliwia zachowanie ich pierwotnej struktury. Co istotne, w przeciwieństwie do krystalografii rentgenowskiej, TEM nie wymaga uprzedniej krystalizacji molekuł. Podczas obrazowania w kriomikroskopie elektronowym próbka jest stale schładzana do temperatury ciekłego azotu, aby utrzymać lód w stanie amorficznym, a także by zmniejszyć uszkodzenia radiacyjne cząsteczek biologicznych. Struktura przestrzenna makromolekuł rekonstruowana jest z tysięcy obrazów pojedynczych cząsteczek (projekcja wsteczna), przedstawiających ich dwuwymiarowe projekcje w przypadkowych orientacjach.

Kriomikroskopia SOLARIS – historia pracowni

Specjalistyczna pracownia Kriomikroskopii SOLARIS powstała w październiku 2018 roku, z inicjatywy konsorcjum, w skład którego weszło osiemnaście najlepszych polskich instytucji naukowych prowadzących badania z zakresu biologii strukturalnej. Konsorcjum działa pod kierunkiem dr hab. Sebastiana Glatta (Małopolskie Centrum Biotechnologii Uniwersytetu Jagiellońskiego w Krakowie) oraz dr hab. Marcina Nowotnego (Międzynarodowy Instytut Biologii Molekularnej i Komórkowej w Warszawie). Oficjalne otwarcie nastąpiło 1 marca 2019 r. podczas Pierwszego Zjazdu Konsorcjum.
Kriomikroskopia SOLARIS w pełni funkcjonuje od września 2019 r., kiedy to mikroskop Krios G3i został po raz pierwszy udostępniony dla użytkowników, w naborze wniosków o dostęp do infrastruktury badawczej. Od tego czasu pracownia wsparła licznych naukowców, z Polski oraz Europy Centralnej i Wschodniej, w ich badaniach mających na celu określenie struktur przestrzennych różnych makrocząsteczek.
Obecnie w SOLARIS dostępne są dwa wysokiej klasy kriomikroskopy – Krios G3i oraz Glacios (oba produkcji Thermo Fisher Scientific) w pełni przeznaczone do pomiarów w zakresie temperatur ciekłego azotu.

Parametry kiriomikroskopów

Parametry Opis
Kriomikroskop Elekrtonowy Krios G3i Krio-TEM  Glacios Krio-TEM
Źródło elektronów Działo elektronowe z emisją polową X-FEG
Napięcie przyspieszające 300 kV 200 kV
Zautomatyzowany Krio-uchwyt Zautomatyzowany krio-uchwyt na siatki TEM umożliwia bezkontaminacyjne przekładanie próbek (do 12 siatek TEM na kasetę)
Soczewki

Zautomatyzowane przesłony: kondensorowe, obiektywowe oraz selektorowe 

Symetryczny układ nabiegunników soczewki obiektywowej stałej mocy typu C-TWIN z szeroką przerwą pomiędzy nabiegunnikami (11 mm) 

Trójkondensorowy układ soczewek EM umożliwia zautomatyzowane, ciągłe obrazowanie w wiązce równoległej  Dwukondensorowy układ soczewek EM (minimalizacja aberracji obrazu i histerezy soczewek przy przełączaniu trybów pracy) 
Goniometr Zautomatyzowany 4-osiowy goniometr z kątem pochyłu ±70 stopni
Jednopochyłowy krio-uchwyt zapewnia optymalną stabilność mechaniczną  Jednopochyłowy krio-uchwyt 
Obrazowanie

Automatyczna korekcja rotacji obrazu podczas zmiany powiększenia 

AFIS (aberration-free image shift) – funkcja umożliwia przesunięcie wiązki elektronów  zamiast przesuwu stolika z próbką. Ograniczenie czasu relaksacji stolika przekłada się na wzrost szybkości obrazowania w trybie SPA. Przesunięcie obrazu odbywa się poprzez przesunięcie i ugięcie wiązki elektronów oraz korekcję aberracji soczewki obiektywowej i osiowej komy. 

FFI (fringe-free imaging) eliminuje prążki interferencyjne na krawędzi wiązki elektronowej. Umożliwia ustawienie kilku miejsc ekspozycji w mniejszym obszarze obserwacji (np. oczko siatki typu quantifoil), co przekłada się na wzrost szybkości zbierania danych.  -
Oprogramowanie Thermo Fisher Scientific: 

EPU - do obrazowania i akwizycji danych, przeznaczone do badań SPA 

Tomography - do obrazowania i akwizycji serii krio-tomograficznych (cryo-ET) 

- EPU-D - do zbierania obrazów dyfrakcyjnych mikro i nanokryształów (µ-ED) 
Detektory

Bezpośredni detektor elektronów Gatan K3 BioQuantum

Bezpośredni detektor elektronów Falcon 3 Thermo Fisher Scientific 

Kamera półprzewodnikowa Ceta 16M CMOS Thermo Fisher Scientific

Bezpośredni detektor elektronów Falcon 4 Thermo Fisher Scientific 

Kamera półprzewodnikowa Ceta-D Thermo Fisher Scientific 

Filtr energii Filtr Energii Gatan BioQuantum (wzmocnienie kontrastu) -
Pozostałe opcje Płytka fazowa Thermo Fisher Scientific (wzmocnienie kontrastu)  -